Struktur Organisasi SMP Sains Tebuireng

Pengasuh/Ketua Yayasan
Mudir Bidang Pendidikan
H. Kunaidi Said, SH., M.Si.

Kepala Sekolah
H. Haerul Anam, S.Pd.I

Komite Sekolah
A. Rofiq, S.T, M.Pd.

Wakil Kepala Sekolah Urusan Kurikulum
Anik Muflihah, S.Pd.

Administrasi Kurikulum
Risky Wulan Suci

Wakil Kepala Sekolah Urusan Kesiswaan
Ah. S.S Arif Khuzaini A. S., S.Pd.I

Administrasi Kesiswaan
Adam Firmansyah

Wakil Kepala Sekolah Urusan Sarana Prasarana

Nola Mariyah Yuliani, S.Pd

Administrasi Sarana Prasarana

Muhammad Hanif Alfani, S.Pd

Kepala Perpusatakaan 
Naila Nisrina Setya Rahma

Kepala Laboratorium
Nur Lailatul Khikmah, S.Pd

Wakil Kepala Sekolah Urusan Human dan Kepegawaian

Abdul Hamid, S.Pd.

Administrasi Humas dan Kepegawaian
Imam El Sadad

Kepala Tata Usaha

Ahmad Fakhruddin Ash S., S.Pd. 

Bendahara

Belinda Ayu Kusuma

Satpam/Keamanan
Mubin

Pengemudi
Anshori Nur Tiktah

Kebersihan
M. Mansur

Pembantu Umum
Suntiani

Tenaga Pengajar

Peserta Didik